全自动细胞计数仪系统内置的先进光学组块可在自动曝光和对焦模式下快速进行细胞成像，并结合分析软件和聚团算法有效识别活死细胞并分别计数。搭配荧光模块时，亦可拓展荧光分析功能。
细胞计数是细胞培养研究中的一项基本研究，它是了解培养细胞生长状态，测定培养基、血清和药物等物质生物作用的重要手段。自动细胞计数器能够在1min以内对培养的细胞分析，并获得细胞活细胞和死细胞浓度、细胞平均体积大小、生存能力、细胞大小或体积分布曲线图。
在细胞培养中，细胞计数是一项基本功，对于刚刚进入实验室开始做细胞实验的我们来说，容易出错的、麻烦的就是给细胞计数，虽然比较简单，但是经常晕头转向、数到眼瞎，而且万一一个不小心被其他人打断了思路，分分钟前功尽弃。
对于贴壁生长的细胞，我们需要首先使用胰酶消化的方法使细胞从培养皿表面脱落。悬浮细胞则无需消化，稀释到合适倍数即可。然后加入适当的含血清培养基，中和胰酶的作用并重悬细胞，以得到均质的细胞悬液。要求尽可能将细胞吹散，不要残留任何细胞团，但不可用力过大。
全自动细胞计数仪还可以用于藻类，微生物等直径细胞计数器范围内的生物。相对血球计数板法，细胞计数仪计数更加准确，快速便捷，误差更小。测定不同时间段的培养液中细胞的浓度，绘制细胞的生长曲线，确定细胞的倍增时间。这是细胞培养过程中必要的一项研究。
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